高速離心機快速提取組織/細胞RNA的實驗步驟
提示:
? 第一次使用前請先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量無水乙醇!
? 操作前在裂解液RLT中加入β-巰基乙醇至終濃度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巰基乙醇。此裂解液最好現用現配。配好的RLT 4℃可放置一個月。
1. 組織培養細胞
a. 收集<107懸浮細胞到一個1.5ml離心管,對于貼壁細胞,孔板培養可以直接裂解,細胞瓶培養應該先用胰蛋白酶消化后吹打下來收集。
b. 13,000rpm離心10秒(或者300g離心5分鐘),使細胞沉淀下來。完全吸棄上清,留下細胞團,注意不完全棄上清會稀釋裂解液導致產量純度降低。
c. 輕彈管壁將細胞沉淀完全松散重懸,加入350μl(<5x106細胞)或者600μl(5x106-1x107細胞)裂解液RLT,吹打混勻后用手劇烈振蕩20秒,充分裂解。
d. 用帶鈍針頭的一次性 1 ml(配0.9mm針頭) 注射器抽打裂解物 5-10 次或直到得到滿意勻漿結果(或者電動勻漿30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高產量。
e. 接操作步驟項下3。
2. 動物組織(例如鼠肝腦)
a. 電動勻漿:新鮮組織用解剖刀迅速切成小碎塊,加入350μl(<20mg組織)或者600μl(20-30mg組織)的裂解液RLT后電動徹底勻漿20-40秒。
b. 液氮研磨+勻漿:在液氮中研磨組織成細粉后,取適量組織細粉(20mg/30mg)轉入裝有350μl/600μl組織裂解液RLT的1.5ml離心管中, 用手劇烈振蕩20秒,充分裂解。用帶鈍針頭的一次性 1 ml(配0.9mm針頭) 注射器抽打裂解物 10 次或直到得到滿意勻漿結果(或者電動勻漿30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高產量。
c. 將勻漿后裂解物13,000rpm離心3分鐘,沉淀可能存在的裂解困難的碎片或者不溶物, 將裂解物上清小心轉到一個新離心管。
d. 接操作步驟項下3。
3. 較精確估計裂解物(上清)體積,加入等體積的70%乙醇(請先檢查是否已加入無水乙醇!),此時可能出現沉淀,但是不影響提取過程,立即吹打混勻,不要離心。
4. 立刻將混合物(每次小于700μl,多可以分兩次加入)加入一個吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm離心60秒,棄掉廢液。
5. 加700μl 去蛋白液RW1,室溫放置30秒,12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。如果DNA殘留明顯,可在加入RW1后室溫放置5分鐘再離心。
6. 加入500μl漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000 rpm 離心30秒,棄掉廢液。加入500μl漂洗液RW,重復一遍。
7. 將吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應。
8. 取出吸附柱RA,放入一個RNase free離心管中,根據預期RNA產量在吸附膜的中間部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加熱可提高產量), 室溫放置1分鐘,12,000 rpm 離心1分鐘。
9. 如果預期RNA產量>30μg,加30-50μl RNase free water重復步驟8, 合并兩次洗脫液,或者使用第一次的洗脫液加回到吸附柱重復步驟一遍(如果需要RNA濃度高)。洗脫兩遍的RNA洗脫液濃度高,分兩次洗脫合并洗脫液的RNA產量比前者高15–30%,但是濃度要低,用戶根據需要選擇。
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